巴蜀书院倡导精神与行动并举的管理文化。
巴蜀书院聘请中国教育学会常务副会长郭振有先生，中国教育学会整体改革专业委员会副会长、秘书长吕敏先生，北京师范大学副校长董奇先生，北京师范大学基础教育课程研究中心教学与教师成长研究室主任芦咏莉女士，北京四中校长刘长铭先生，中国教育学会副会长、北京实验二小校长李烈女士，北京光明小学校长刘永胜先生，英国利物浦圣女贞德学校校长史蒂夫先生，美国Heritage Hall学校校长布郎博先生，重庆市教育科学研究院院长万明春先生，西南大学教育学院副院长朱德全先生担任学校学术顾问，为学校发展提供学术引领和支持。
巴蜀书院聘请资深新闻工作者、重庆诗词学会副秘书长张学文先生担任学校文化顾问。
巴蜀书院聘请重庆鲁能开发集团有限公司总经理刘宇先生，百君律师事务所副主任律师王红星先生，重庆中咨会计师事务所所长江国华先生担任学校管理、法律、财务顾问。
巴蜀书院聘请重庆市巴蜀小学党总支书记、校长廖文胜先生担任学校名誉校长。廖文胜先生是中学高级教师，特级教师，享受国务院津贴的专家，兼任中国教育学会常务理事，中国教育学会小学教育专业委员会副理事长，重庆市教育学会副会长。
巴蜀书院聘请原重庆市巴蜀小学校副校长张晓春女士担任学校教学顾问。张晓春女士是享受国务院津贴的专家、重庆市语文特级教师、重庆市名师。
巴蜀书院聘请重庆市巴蜀小学校长助理马宏女士担任执行校长。马宏女士是中共党员，中学高级教师，全国“三八”红旗手，重庆市教育学会行政管理专业委员会副秘书长，重庆市教科文卫体工会第一届委员会常务理事，重庆市教育学会会员，重庆市教育学会德育专业委员会会员。巴蜀书院聘请巴蜀小学原中层领导干部和巴蜀小学原管理团队成员组成学校管理团队实施管理，确保巴蜀书院的管理在继承中发扬，在发扬中发展，不断提升巴蜀管理的理念与行动力。